在空气中冷却鱼类多在鲜鱼冷却室内进行，这种鲜鱼冷却室设在鱼品加工厂内，以便在加工前冷却鲜鱼之用，冷却室的温度保持在0℃，为防止鱼箱内冰的融化，为了防止冷却室的冷量损失，冷却室与鱼的前处理车间仅以通道相连，冷却室与通道和鱼的前处理车间的地面应处于同一水平（或略低于冷却室，防止水流入冷却室内）。
　　（1）鲜鱼冷却室：可冷藏保证鱼处理车间一昼夜生产的原料，最小的冷藏面积约为40㎡，夏季放置鱼箱，每一个单位面积（40㎡）约放置8t鱼货，等于一个车厢的装运量。
　　（2）放置鱼箱方法：有两种，在鱼货少时将鱼箱依次成十字放置，或中间不加垫木仅哎第一层鱼箱下放置垫木。在贮藏大量鱼时，应将鱼箱依次平行堆放，箱与箱中间放置垫木，尺寸长53cm，厚约5cm，为垫木上免于积存污物和易于洗涤，垫木应用抛光的硬质木材制成。放置鱼箱时应遵守下列间隔标准。各箱垛间隔为10cm；箱垛与墙间隔为30cm；箱垛与蒸发管间隔为50cm。为了保证每批鱼装入冷却室方便起见，应留出宽250cm的通道。
　　冷却室中的温度不能过低，以免形成慢冻而影响鱼的质量，一般保持0~-1℃为止，冷却室中一般保持一昼夜的原料鱼数量较为适宜。垫木要时常冲洗防止霉菌的繁殖，冷却室在不堆放鱼货时可将门开着，防止产生霉味，或用鼓风机将室内的静止空气换去。
　　每年至少对冷却室进行两次消毒，消毒方法，可用1%碱液或0.2%热肥皂水洗刷垫土、墙壁、地面、天花板等，然后再用冷水冲。